Für Lebensmittelzusatzstoffe, -aromen und -enzyme soll es nach einem Vorschlag der EU-Kommission vom 28. Juli 2006 künftig ein einheitliches und vereinfachtes Zulassungsverfahren geben. In Deutschland, wie auch in den meisten anderen Mitgliedstaaten gab es bislang kein Zulassungsverfahren für Enzyme. Diese Wirkstoffe spielen in der Lebensmittelerzeugung aber eine immer größere Rolle. Sie unterstützen Herstellungsprozesse wie das Gehen des Brotteigs und oder das Klären von Säften. In der Vergangenheit galten Lebensmittelenzyme zwar nicht als toxisch, auf europäischer Ebene gab es aber keine Sicherheitsbewertung. Das soll sich nun ändern. Der Verordnungsentwurf sieht eine Positivliste für alle Lebensmittelenzyme vor. In diese Liste werden nur Enzyme aufgenommen, für die es auch eine befürwortende Stellungnahme der Europäischen Behörde für Lebensmittelsicherheit, EFSA, gibt. Der Verordnungsvorschlag enthält auch Vorschriften für die Kennzeichnung von Enzymen.